Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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