Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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USF2Q15853 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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