Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RAB35Q15286 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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