Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMC1AQ14683 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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