Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM29Q14134 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms