Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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SHROOM2Q13796 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
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