Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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HTR4Q13639 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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