Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms