Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CAMK2BQ13554 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms