Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TUBB3Q13509 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBB3Q13509 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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