Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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