Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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NME3Q13232 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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