Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMD2Q13200 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms