Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms