Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms