Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms