Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms