Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms