Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms