Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms