Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms