Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms