Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms