Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPL23P62829 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPL23P62829 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms