Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms