Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms