Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2A2P52657 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms