Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGSHP51688 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGSHP51688 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGSHP51688 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGSHP51688 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGSHP51688 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms