Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMD8P48556 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms