Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTGER3P43115 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTGER3P43115 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER3P43115 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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