Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H1P32780 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms