Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms