Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCAP28676 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCAP28676 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms