Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNA2P26232 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms