Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP4AP20648 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms