Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms