Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGGP02679 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGGP02679 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGGP02679 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGGP02679 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms