Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPAG9O60271 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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