Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBDO15205 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBDO15205 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBDO15205 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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