Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms