Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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