Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP99D6REC4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFAP99D6REC4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms