Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms