Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGB1P1B2RPK0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms