Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ISM1B1AKI9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms