Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP3K4Q9Y6R4 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms