Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDY1Q9Y6F8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDY1Q9Y6F8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms