Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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USP20Q9Y2K6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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