Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms