Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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